Ecologie : P. minkoiensis se rencontre dans la zone intertidale à subtidale peu profonde, entre 2 et 12 m dans les habitats récifaux.
Espèces proches : Au moins trois autres espèces de l'Indo-Ouest Pacifique ont une coloration vert- jaune : P. luteus, P. olivaceus et P. paulayi. P. luteus, plus jaune, est connue du Pacifique ouest et cetral, P. olivaceus qui possède des points sur les parapodes, est considérée comme endémique de la mer Rouge.
Seule P. paulayi peut ête confondue avec P. minikoiensis car présente dans l'océan Indien et dans le Pacifique ouest.
Les études génétiques ont montré que P minikoiensis est une espèce soeur de P. cylindricus, de l'océan Pacifique occidental et central.